La bactériothérapie fécale (FB), également appelée transplantation de microbiote fécal (FMT) ou transplantation de microbiote intestinal (IMT), est un type de thérapie utilisé depuis de nombreuses années pour traiter différentes affections, notamment celles centrées sur le tube digestif. Il est étudié pour être utilisé dans le traitement d’affections allant des maladies inflammatoires de l’intestin (MII), et de la colite ulcéreuse en particulier, au syndrome du côlon irritable (SCI) et à l’obésité. Cependant, jusqu’à présent, la plupart des études ont été de petite envergure et les résultats pour toutes les conditions ont été incohérents.
La transplantation fécale se fait dans des cliniques spécialisées, elle n’est donc pas disponible partout et elle est actuellement réservée à des patients spécifiques. À la suite de certaines études prometteuses pour l’avenir des transplantations fécales en tant que thérapie, certaines personnes choisissent d’essayer d’effectuer ce traitement à domicile.
Il n’est pas recommandé aux gens de suivre les instructions de bricolage en ligne qui décrivent comment prendre les excréments de quelqu’un d’autre et les introduire dans leur propre corps.
Il existe de sérieux risques, notamment d’infection et d’autres effets indésirables dont nous ne connaissons même pas les conséquences potentielles à long terme.
Le Dr Neilanjan Nandi, gastro-entérologue au Drexel Medicine à Philadelphie et leader d’opinion clé dans le domaine des transplantations fécales, demande : “Quand il s’agit de la santé de votre intestin, quelle confiance voulez-vous accorder à l’expérience anecdotique des bricoleurs en ligne pour des indications non établies et sans données validées sur la sécurité des patients ?”
Transplantation de microbiote fécal
Les greffes fécales sont utilisées depuis 1958, lorsqu’elles étaient utilisées pour traiter des patients luttant contre de graves infections causées par la bactérie. Clostridioides difficile (C. difficile).La vie de ces patients était en jeu et les médecins ont eu recours à des greffes fécales pour tenter de leur sauver la vie. Cela a fonctionné.
Une greffe fécale est à peu près ce à quoi cela ressemble : les selles d’une personne sont introduites dans le système digestif d’une autre personne.
Bien entendu, il ne s’agit pas d’un simple transfert de matières fécales brutes. Plusieurs étapes sont nécessaires pour préparer les selles au transfert.
Les donneurs de selles doivent être soigneusement sélectionnés afin d’éviter d’introduire une maladie ou d’autres effets indésirables chez un receveur. Non seulement les selles des donneurs doivent être testées pour garantir qu’elles sont aussi sûres que possible, mais elles doivent également être traitées et transformées sous une forme utilisable.
La Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis avait classé les selles utilisées pour les transplantations fécales comme « nouveau médicament expérimental » jusqu’en novembre 2022, date à laquelle la FDA a approuvé le premier produit du microbiote fécal, Rebyota.
Il n’est pas approuvé pour un usage général et n’est dans certains cas pas couvert par une assurance sauf pour le traitement des problèmes récurrents.C. difficileinfection.
Risques des greffes fécales faites maison
La composition bactérienne des selles est extraordinairement complexe. L’étude du microbiote est un domaine de recherche en évolution. Il est possible que la flore intestinale de chaque personne soit si unique qu’elle fasse presque office d’empreinte digitale : il n’y en a pas deux exactement identiques.
Les chercheurs commencent tout juste à comprendre non seulement ce que contient notre système digestif, mais également comment la génétique, l’environnement, l’alimentation et les maladies l’affectent au cours de notre vie. La question plus vaste qui reste en suspens est de savoir comment notre flore intestinale affecte notre santé et le développement de maladies.
Introduction d’agents pathogènes potentiellement nocifs
Sans un dépistage approprié, on ne sait pas ce qui pourrait se trouver dans les selles d’une personne. Même une personne apparemment en bonne santé et ne présentant aucun symptôme (digestif ou autre) pourrait avoir dans ses selles quelque chose de potentiellement nocif. Le contenu des selles d’un donneur peut contenir quelque chose qui ne pose pas de problème chez une personne en bonne santé, mais pour une personne souffrant d’une infection, d’un problème digestif ou d’une maladie grave, cela pourrait avoir des conséquences inattendues.
On pourrait penser que l’utilisation des selles d’un proche (et notamment celles des enfants) apporterait un certain niveau de certitude ou de sécurité. Même si le donneur est connu de la personne greffée, rien ne garantit que les selles ne contiennent pas quelque chose de potentiellement nocif.
Sans tests effectués par des scientifiques en milieu clinique, le contenu des selles ne peut être connu. Trop de variables peuvent affecter le microbiote.
C’est pourquoi il est déconseillé à quiconque d’essayer une greffe de selles fécales à domicile, sans la supervision d’un médecin.
Dommages au rectum ou au côlon
Les autres risques liés aux transplantations fécales incluent ceux liés au fait de déposer les selles là où elles doivent aller (à travers l’anus et dans le rectum et au-delà). Effectuer la procédure à la maison avec des selles qui n’ont pas été traitées par un laboratoire signifie probablement utiliser un lavement pour insérer les selles dans le rectum et/ou le côlon.
Même lorsque les transplantations fécales sont effectuées en milieu clinique par un médecin, il existe des risques de percer un trou (perforation) dans le rectum ou le côlon.Le faire à la maison sans la supervision d’un médecin ou d’un autre professionnel de la santé pourrait également exposer un patient à ces complications et à d’autres. De plus, le matériel de transplantation fécale doit être délivré par coloscopie afin d’atteindre le côlon droit pour être pleinement efficace.
Comment les selles du donneur sont sélectionnées
Le processus pour devenir donneur de selles est long. Les donneurs sont généralement des adultes en bonne santé âgés de 18 à 50 ans et doivent d’abord répondre à une série de questions sur leur santé. Il y a ensuite un entretien en personne qui est complété. À ce stade, le donneur potentiel fait analyser son sang et ses selles pour déceler tout ce qui pourrait être nocif, comme une infection par une bactérie ou un agent pathogène.
Il existe une multitude de critères d’exclusion, qui sont des conditions ou des choix de mode de vie qui empêcheraient un donneur potentiel de donner ses selles. Ceux-ci peuvent inclure :
- Avoir des antécédents de problèmes de santécomme tout trouble digestif, infections topiques, syndrome de douleur chronique, troubles métaboliques, troubles psychiatriques ou maladies auto-immunes
- Utilisation d’antibiotiquesau cours des trois mois précédents
- Avoir la diarrhée
- Une histoire familiale de MIIou cancer digestif
- Antécédents personnels de cancerou chimiothérapie
- Voyager dans certaines régions du mondeau cours des trois mois précédents
Le sang des donneurs potentiels est testé pour le virus de l’hépatite, le VIH, le virus Epstein-Barr ainsi que pour les champignons. En outre, une formule sanguine complète, un panel métabolique complet, un panel de fonctions hépatiques, la vitesse de sédimentation des érythrocytes et des tests de protéine C-réactive peuvent également être effectués.
Comme on peut s’en douter d’après cette longue liste : de nombreux donateurs potentiels sont exclus.
Les normes rigoureuses font que seulement 3 % des donneurs de selles sont acceptés.
Comment les selles du donneur sont traitées
Une fois qu’un donneur est sélectionné et qu’un échantillon de selles est reçu, les selles sont ensuite testées de différentes manières.
Un tabouret est d’abord inspecté visuellement et comparé au type de tabouret Bristol pour s’assurer qu’il se situe dans une fourchette saine (et qu’il n’est ni trop dur ni trop lâche). Les selles sont ensuite filtrées pour éliminer tout ce qui n’y appartient pas, comme les aliments non digérés.
Des tests sont effectués pour garantir qu’il ne contient pas d’agents pathogènes viraux ou parasitaires, ni de bactéries potentiellement nocives telles queC. difficile. Les selles du donneur peuvent également être testées pour voir ce qu’elles contiennent (par opposition à ce qu’elles ne contiennent pas). C’est-à-dire quelles souches de bactéries présentes sont normales et/ou attendues dans les selles et combien d’entre elles se trouvent dans un échantillon.
La mort déclenche un avertissement de la FDA
Au-delà des tests, une multitude de mesures supplémentaires et de freins et contrepoids sont mis en place pour la protection de ceux qui recevraient les selles du donneur.
Des événements indésirables sont survenus même après tous ces tests rigoureux sur les donneurs et les selles. Dans un cas, une personne recevant une greffe fécale est décédée et il a été découvert que les selles contenaient des bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE)E. coli. Une deuxième personne recevant les mêmes selles a également été infectée par la bactérie.
Le décès d’un patient recevant une greffe fécale a incité la FDA à émettre un avertissement sur les risques de la procédure. Dans un communiqué, la FDA a reconnu que les thérapies expérimentales sont importantes mais que les risques ne doivent pas être négligés.
Le Dr Nandi souligne que « le décès récent d’un patient post-IMT était associé à des selles du donneur possédant un MDRO (organisme multirésistant) pathogène. Le statut MDRO du receveur serait inconnu, mais le donneur n’a notamment pas été sélectionné à l’avance. Cela aurait pu être évité. »
L’agence a ensuite recommandé aux médecins d’avertir les patients du risque d’infection par des organismes multirésistants et a réaffirmé leur engagement en faveur de la protection et de la sécurité des patients.
Transplantations fécales pour diverses conditions
Les chercheurs continuent de l’étudier car il semble prometteur. Dans la plupart des cas, les auteurs de l’étude demandent des essais contrôlés randomisés qui aideront à comprendre comment ce traitement pourrait fonctionner et pour quels patients il pourrait aider.
Pour les MII
Les deux principales formes de MII, la colite ulcéreuse (CU) et la maladie de Crohn (MC), sont des affections dans lesquelles une réponse immunitaire anormale provoque des épisodes d’inflammation dans le tube digestif. On pense qu’une perturbation des bactéries intestinales normales est l’un des déclencheurs de cette réponse. La FMT a donc été étudiée comme traitement possible des MII.
Jusqu’à présent, la plupart des recherches se sont concentrées sur les CU. Une revue des preuves publiée en 2023 dans la bibliothèque Cochrane a conclu que la FMT peut augmenter la probabilité de rémission chez les personnes atteintes de CU active légère à modérée. Il n’était cependant pas clair si la FMT pourrait aider à maintenir la rémission chez les personnes dont la CU est déjà sous contrôle, ou si le traitement améliore la qualité de vie.
Il n’y avait pas suffisamment de preuves pour tirer des conclusions sur les avantages de la MC.
Jusqu’à présent, les études ont été relativement petites (les 12 études de la revue Cochrane incluaient 550 participants) et les auteurs ont déclaré que les preuves étaient de « faible certitude ». Ils ont déclaré que des recherches supplémentaires étaient nécessaires pour établir les avantages et la sécurité de la FMT pour les MII.
Pour C. Difficile
Les transplantations fécales sont parfois utilisées dans le traitement de C. difficileinfection. Cette bactérie se trouve normalement dans le côlon des personnes en bonne santé, aux côtés de milliards d’autres bactéries.
Parfois, cependant, la composition bactérienne peut être déséquilibrée. Cela peut se produire pour plusieurs raisons, notamment un traitement aux antibiotiques, des changements de régime alimentaire ou des niveaux de stress élevés.
La plupart du temps, le fait que la flore intestinale s’éloigne de ses niveaux normaux n’entraînera pas de maladie grave, bien que cela puisse provoquer des symptômes tels que des ballonnements. Cependant, il peut arriver que le déséquilibre donneC difficileune opportunité de se développer de manière incontrôlable dans le tube digestif, surtout après qu’une personne a reçu un traitement aux antibiotiques.
Un domaine dans lequel les transplantations fécales se sont révélées efficaces est le traitement d’une infection parC. difficile, et en particulier ce qu’on appelle l’infection réfractaire où les traitements conventionnels aux antibiotiques ne parviennent pas à éliminer la bactérie. Les patients atteints de ce type d’infection peuvent être gravement malades et l’introduction de quelque chose de nocif dans leur corps pourrait avoir des conséquences importantes, voire la mort. En fait, l’infection parC. difficilea causé plus de 29 000 décès en 2011.
En 2022, la FDA a approuvé Rebyota, le premier produit du microbiote fécal, et en 2023, Vowst, le premier produit du microbiote fécal pris par voie orale. Rebyota et Vowst sont approuvés pour la prévention de la récidive de C.diffinfections chez les adultes ayant terminé un traitement antibiotique pour des infections récurrentes C.diffinfections.
Un mot de Gesundmd
Même certains partisans des greffes fécales à faire soi-même recommandent de faire tester les selles du donneur avant de les utiliser. Cependant, il n’existe aucun laboratoire à la disposition des consommateurs qui puisse tester les selles avec la rigueur qui est effectuée dans les laboratoires qui fournissent les selles des donneurs aux médecins pour le traitement et les essais cliniques. Et, en fait, dans au moins un cas, même ces tests effectués dans un environnement clinique n’ont pas suffi à détecter une bactérie qui s’est avérée nocive et qui a finalement causé un décès.
De plus, les laboratoires qui traitent les selles des donneurs destinées à être utilisées par les médecins ont également mis en place d’autres protections, telles que la conservation des échantillons de selles envoyés afin de les rendre disponibles pour tout test nécessaire à une date ultérieure. De plus, les analyses de sang effectuées sur les donneurs potentiels sont nombreuses, pour ne pas dire coûteuses, et ne seront pas couvertes par une assurance pour une greffe à faire soi-même.
Comme le déclare le Dr Nandi : « Les selles d’un donneur mal examinées peuvent transmettre des infections provoquant des poussées de MII. Ceci est évitable si l’on utilise des protocoles académiques établis, mais il est très coûteux de le poursuivre de manière indépendante, en particulier pour le bricoleur. »
Les personnes qui vivent avec des troubles digestifs tels que les MII ou le SCI sont confrontées à des défis importants dans leur vie quotidienne pour faire face aux symptômes, ce qui rend l’idée de la transplantation fécale attrayante. Il n’est pas surprenant que certaines personnes prennent les choses en main et se demandent probablement quel pourrait être le mal d’utiliser les selles d’un membre de la famille en bonne santé.
Cependant, les risques potentiels sont réels et graves, sans parler des effets involontaires qui pourraient survenir et qui pourraient ne pas mettre la vie en danger, mais pourraient aggraver davantage la détérioration de la santé. Les greffes fécales pourraient être utilisées à l’avenir pour traiter toutes sortes de maladies et d’affections, mais dans l’état actuel des choses, on n’en sait tout simplement pas assez sur nos bactéries intestinales.
Il est préférable de réserver ce traitement à ceux qui en ont vraiment besoin, dans un cadre médical.
