Échantillons de crachats et de sang et tests de laboratoire de culture

Qu’est-ce qu’une culture microbienne?

Une culture microbienne est l’une des méthodes de diagnostic de la microbiologie et est utilisée pour déterminer la cause d’une maladie infectieuse en permettant au micro-organisme de se multiplier dans certains milieux spécifiques dans des conditions de laboratoire contrôlées. Cela aide à déterminer le type ainsi que la gravité de l’infection en comptant les colonies de l’organisme dans l’échantillon.

Types d’échantillons pour la culture microbienne

Les infections microbiennes peuvent être causées par des bactéries, des virus, des champignons et des parasites et l’échantillon à collecter pour la culture dépend des signes et des symptômes de la maladie. La quantité correcte d’échantillon doit idéalement être collectée avant de commencer le traitement avec un agent antimicrobien, comme un antibiotique, et une fois extraite, elle doit être transportée immédiatement au laboratoire pour la culture. Des précautions spéciales doivent être prises pour éviter la contamination de l’échantillon par des organismes présents dans la peau environnante, la membrane muqueuse et l’air, pendant le prélèvement. Des tests de sensibilité peuvent également être effectués pour déterminer la sensibilité relative des micro-organismes individuels à certains médicaments.

 

Les types d’échantillons pouvant être utilisés pour la culture sont:

  • Sang (voir hémoculture)
  • Expectorations (reportez-vous à la culture des expectorations)
  • Urine
  • Tabouret
  • Liquide céphalo-rachidien (LCR)
  • Exsudats de la plaie
  • Pus
  • Sécrétions respiratoires
  • Écouvillon de gorge
  • Écoulement urétral
  • Écoulement vaginal ou cervical
  • Grattages cutanés
  • Exsudats ou pus des oreilles et des yeux
  • Culture bronchoscopique

Qu’est-ce qu’une culture d’expectoration?

Le matériel qui est craché des poumons puis craché ou expectoré est appelé expectoration ou parfois appelé mucosités. Une culture d’expectoration est effectuée pour identifier le micro-organisme responsable des infections des voies respiratoires inférieures telles que la pneumonie et la tuberculose. Une fièvre accompagnée d’une toux chronique, associée à du sang ou à du pus dans les expectorations, est généralement une indication pour entreprendre une culture d’expectoration.

Collection d’échantillons d’expectorations

Les expectorations doivent être collectées dans un récipient stérile, de préférence tôt le matin avant de manger ou de boire quoi que ce soit. La bouche doit être rincée à l’eau pour éliminer les bactéries de la bouche et diluer la salive qui peut contaminer l’échantillon. Avec une toux violente, les expectorations doivent être crachées immédiatement dans le récipient stérile, en évitant un prélèvement prolongé dans la cavité buccale. Trois échantillons consécutifs peuvent être prélevés en cas de dépistage de la tuberculose.

Une coloration spéciale appelée coloration acido-résistante peut être réalisée en laboratoire pour identifier les bacilles tuberculeux. Différents types de micro-organismes peuvent être identifiés en utilisant une coloration de Gram. Une culture fongique peut être effectuée si une infection fongique est suspectée et une culture virale est effectuée pour détecter une infection virale telle qu’une pneumonie. En raison de la prévalence des infections bactériennes des voies respiratoires, la plupart des échantillons de crachats sont d’abord testés pour les bactéries.

Rapport sur la culture des expectorations

Culture bactérienne

Le rapport initial indiquant la présence de toute bactérie peut être disponible le même jour. Le rapport final prendra entre un et trois jours et comprendra l’identification du type et de la quantité spécifiques de bactéries ainsi que des antibiotiques les plus efficaces contre elle. La culture pour la tuberculose peut prendre de deux à quatre semaines.

Culture fongique

Les rapports peuvent prendre plusieurs semaines.

Culture virale

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Cela peut prendre plusieurs jours à plusieurs semaines pour obtenir le rapport en fonction du type de virus présent.

Qu’est-ce qu’une hémoculture?

Ce test est conseillé lorsqu’il y a des symptômes d’infection sanguine tels qu’une septicémie ou une bactériémie et qu’une hémoculture est effectuée pour identifier la bactérie ou un autre micro-organisme. Une culture microbienne sanguine sera demandée par votre médecin en fonction de vos antécédents et des résultats cliniques à l’examen physique.

Prélèvement d’échantillons de sang

Environ 10 ml (0,3 oz liq.) De sang sont prélevés avec une aiguille et une seringue d’une veine, soit à l’intérieur du coude, soit sur le dos de la main, et collectés dans deux flacons. Il est envoyé au laboratoire où il est placé sur une boîte de Pétri avec de la gélose. C’est le milieu idéal pour la croissance bactérienne et après incubation, il indiquera des zones claires de croissance bactérienne s’il y avait des bactéries présentes dans l’échantillon de sang.

Une hémoculture est effectuée principalement pour les bactéries et si une croissance est observée, des tests supplémentaires sont effectués pour identifier le type de bactérie. Une coloration de Gram peut être effectuée en utilisant des types spéciaux de coloration pour identifier différents organismes. Certains micro-organismes captent et conservent la couleur violette et sont appelés organismes gram-positifs , tandis que d’autres organismes perdent la tache violette et conservent la tache rouge et sont appelés gram-négatifs . Aucune préparation particulière n’est nécessaire avant une hémoculture et il n’y a pas beaucoup d’inconfort sauf pour la piqûre à l’aiguille.

Une valeur normale signifie qu’aucun organisme ne peut être cultivé en laboratoire et qu’il n’y a donc pas d’infection dans le sang, tandis qu’un résultat positif montrera la croissance et la multiplication des organismes dans l’échantillon. Le traitement peut alors être commencé en fonction du micro-organisme identifié et de la sensibilité ou de l’action de divers médicaments sur celui-ci. Trois hémocultures peuvent être nécessaires pour confirmer les résultats en raison d’une infection bactérienne variable dans le sang.

Rapport d’hémoculture

Le rapport initial ou préliminaire indiquera si des bactéries ont été trouvées et les résultats devraient être disponibles dans un délai d’une journée, selon le pays ou le laboratoire. Le rapport final montrera le type de bactérie et sa sensibilité aux antibiotiques, et cela peut être disponible après cinq à sept jours.

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