Les tests génétiques, également appelés tests ADN, consistent à obtenir l’ADN d’un échantillon de cellules de votre corps afin d’identifier des gènes, des chromosomes ou des protéines spécifiques, y compris ceux qui sont défectueux (appelés mutations).
Les tests peuvent aider à identifier la lignée génétique, à confirmer ou à exclure une maladie génétique héréditaire, à évaluer votre risque de développer ou de transmettre une maladie génétique et à sélectionner les médicaments les plus efficaces en fonction de votre profil génétique. Les tests peuvent être effectués sur le sang, l’urine, la salive, les tissus corporels, les os ou les cheveux.
Objectif du test
Votre médecin peut demander un test génétique pour un certain nombre de raisons liées au diagnostic, à la prévention et au traitement. Les tests génétiques peuvent également être utilisés dans les enquêtes judiciaires. Il existe même des tests destinés directement au consommateur capables de retracer votre ascendance.
Comment fonctionnent les tests génétiques
Presque toutes les cellules de votre corps contiennent de l’ADN, des gènes et des chromosomes. Chacun remplit une fonction spécifique et interdépendante :
- L’ADN (acide désoxyribonucléique) est une molécule double brin qui contient toutes les informations génétiques vous concernant en tant qu’individu. L’ADN est composé de quatre substances appelées adénine (A), thymine (T), cytosine (C) et guanine (G). La séquence unique de ces substances fournit le « code de programmation » de votre corps.
- Un gèneest une partie distincte de l’ADN qui contient les instructions codées sur comment et quand construire des protéines spécifiques. Même si un gène est censé fonctionner de manière standard, tout défaut dans son codage ADN peut affecter la manière dont ces instructions sont transmises. Ces défauts sont appelés mutations génétiques.
- Un chromosomeest une unité regroupée de gènes. Chaque être humain possède 46 gènes, dont 23 sont hérités respectivement de la mère et du père. Chaque chromosome contient entre 20 000 et 25 000 gènes.
Depuis le début des années 1900, les scientifiques ont compris que des variations génétiques spécifiques (génotypes) se traduisent par des caractéristiques physiques spécifiques (phénotypes). Ces dernières années, les progrès technologiques et une meilleure compréhension du génome humain ont permis aux scientifiques d’identifierlequelles mutations confèrent à certaines maladies ou caractéristiques.
Types de tests génétiques
Les tests génétiques ont de vastes applications dans des contextes médicaux et non médicaux. Ils comprennent :
- Tests diagnostiquespour confirmer ou exclure une maladie génétique
- Tests de porteureffectué avant ou pendant la grossesse pour voir si vous et votre partenaire êtes porteurs d’un gène susceptible de provoquer une anomalie congénitale
- Diagnostic prénataldétecter des anomalies dans les gènes du fœtus avant la naissance pour identifier des troubles congénitaux ou des malformations congénitales
- Dépistage néonataldépister régulièrement les maladies héréditaires, comme l’exige la loi
- Tests préimplantatoiresutilisé pour dépister les embryons à la recherche d’anomalies dans le cadre du processus de fécondation in vitro (FIV)
- Diagnostic prédictifpour estimer votre risque (prédisposition) de développer une maladie génétiquement influencée, comme le cancer du sein, plus tard dans la vie
- Tests pharmacogénétiquespour déterminer si votre génétique peut influencer votre réponse aux thérapies médicamenteuses, en particulier la résistance génétique aux virus comme le VIH
Les utilisations non médicales des tests génétiques comprennent les tests de paternité (utilisés pour identifier les modèles d’héritage entre individus), les tests généalogiques (pour déterminer l’ascendance ou l’héritage) ou les tests médico-légaux (pour identifier un individu à des fins juridiques).
Tests actuellement disponibles
Le nombre de tests génétiques disponibles pour diagnostiquer une maladie augmente chaque année. Dans certains cas, les tests peuvent être plus suggestifs que diagnostiques étant donné que la compréhension de la génétique des maladies (comme le cancer et les maladies auto-immunes) reste limitée.
Parmi certains des tests génétiques actuellement utilisés pour le diagnostic :
- Becker/Duchenneassocié à la dystrophie musculaire
- BRCA1etMutations BRCA2associé aux cancers du sein, des ovaires et de la prostate
- Criblage d’ADN acellulaireutilisé pour diagnostiquer le syndrome de Down
- Mutations CTFRassocié à la mucoviscidose
- Mutations FHassocié à une hypercholestérolémie familiale
- Mutations FMR1liés à l’autisme et à la déficience intellectuelle
- Mutations MHassocié à la maladie de Huntington
- Mutation HEXAassocié à la maladie de Tay-Sachs
- Mutations HBBassocié à l’anémie falciforme
- Mutations IBD1lié à la maladie inflammatoire de l’intestin (MII)
- Mutations LCTassocié à une intolérance au lactose
- NEM2AetMutations NEM2Bassocié au cancer de la thyroïde
- Mutations NOD2associé à la maladie de Crohn
- Mutations PAI-1, prédictif de maladie coronarienne (MAC) et d’accident vasculaire cérébral
Risques et contre-indications
Les risques physiques des tests génétiques sont faibles. La plupart nécessitent un échantillon de sang ou de salive ou un prélèvement de l’intérieur de la joue (appelé frottis buccal). Selon les objectifs du test, il peut suffire de quelques gouttes de sang (comme pour le dépistage néonatal ou le test de paternité) ou de plusieurs flacons (pour le dépistage du cancer ou du VIH).
Si un cancer est suspecté, une biopsie peut être réalisée pour obtenir des cellules d’une tumeur solide ou de la moelle osseuse. Les risques liés à la biopsie peuvent varier en fonction du caractère invasif de la procédure, allant de la douleur localisée et des ecchymoses aux cicatrices et aux infections.
Risques prénatals
Les tests génétiques prénatals sont généralement effectués sur le sang maternel. Un exemple est le test d’ADN fœtal acellulaire (cfDNA) effectué après la 10e semaine de grossesse. Les risques pour la mère et le bébé ne sont pas plus grands que ceux liés à une prise de sang effectuée sur une personne non enceinte.
Des tests génétiques peuvent également être effectués sur du liquide amniotique obtenu paramniocentèse. L’amniocentèse peut être utilisée pour réaliser un caryotype, qui permet de dépister des troubles génétiques tels que le syndrome de Down, la mucoviscidose et des anomalies du tube neural comme le spina bifida. Les effets secondaires peuvent inclure des crampes, une douleur localisée au site de ponction et une perforation accidentelle de la vessie. L’amniocentèse comporte un risque de fausse couche d’un sur 400.
En revanche, les échantillons obtenus par prélèvement de villosités choriales (CVS) peuvent entraîner une fausse couche dans une procédure sur 100. Le CVS peut être utilisé pour dépister les mêmes affections congénitales, à l’exception des anomalies du tube neural. Il n’est pas recommandé aux femmes présentant une infection active, qui attendent des jumeaux ou qui ont des saignements vaginaux, entre autres. Les effets secondaires peuvent inclure des saignements, des crampes ou une infection.
Considérations
Au-delà des risques physiques liés aux tests, les éthiciens restent préoccupés par l’impact émotionnel de l’apprentissage selon lequel vous pourriez ou non développer une maladie grave dans des années, voire des décennies. L’incertitude peut engendrer du stress quant à votre avenir et/ou à votre capacité à obtenir une assurance maladie ou vie en cas de besoin.
Des efforts sont déployés pour répondre à certaines de ces préoccupations. En 2009, le Congrès américain a adopté la loi GINA (Genetic Information Non-Discrimination Act), interdisant toute discrimination en matière d’assurance maladie ou d’emploi fondée sur les résultats d’un test génétique. Malgré les efforts visant à élargir la protection, le GINA ne s’applique pas aux entreprises de moins de 15 salariés et n’empêche pas les pratiques discriminatoires parmi les assureurs-vie.
Si vous envisagez un test électif, il est important de rencontrer un conseiller en génétique qualifié pour bien comprendre les avantages, les risques et les limites du test. Cela inclut votre « droit de ne pas savoir » si des découvertes involontaires sont découvertes.
Dans certains cas, savoir que vous avez une prédisposition génétique à une maladie comme le cancer du sein peut vous aider à prendre des décisions importantes concernant votre santé. À d’autres moments, connaître une maladie qui peut ou non se développer et pour laquelle il n’existe aucun traitement n’est peut-être pas une chose à laquelle vous souhaitez faire face. Il n’y a pas de bonne ou de mauvaise réponse dans aucun des deux domaines ; il n’y a qu’un choix personnel.
Avant l’épreuve
Un test génétique ne nécessite pas beaucoup de préparation de votre part. La seule exception peut être les tests prénatals, qui nécessitent parfois des restrictions alimentaires et/ou hydriques.
Timing
Selon le but de l’enquête, la réalisation d’un test génétique peut prendre seulement quelques minutes.
À l’exception des kits d’ascendance destinés directement aux consommateurs, la plupart des tests génétiques impliqueront un certain niveau de conseil préalable au test. Même si votre médecin demande le test dans le cadre d’une enquête en cours, attendez-vous à passer au moins 15 minutes au laboratoire ou à la clinique (sans compter le temps d’attente).
Les tests prénataux peuvent prendre de 30 à 90 minutes, selon que l’amniocentèse, le CVS transabdominal ou le CVS transcervical sont ordonnés.
Les biopsies peuvent prendre plus de temps, en particulier celles impliquant la moelle osseuse ou le côlon. Bien que la procédure puisse prendre seulement 10 à 30 minutes, le temps de préparation et de récupération peut ajouter une heure supplémentaire si un sédatif intraveineux (IV) est utilisé.
Emplacement
Les échantillons génétiques peuvent être obtenus dans un cabinet de soins de santé, une clinique, un hôpital ou un laboratoire indépendant. Le dépistage prénatal est effectué en cabinet. Certaines biopsies, comme l’aspiration à l’aiguille fine, peuvent être réalisées dans le cabinet d’un praticien ; d’autres sont effectués en ambulatoire dans un hôpital ou une clinique.
Les tests d’échantillons en laboratoire médical sont généralement effectués dans un laboratoire certifié en vertu des Clinical Laboratory Improvement Amendments (CLIA) et du College of American Pathologists (CAP). Vous pouvez demander à votre fournisseur de vérifier cela pour vous assurer que le laboratoire répond à ces normes strictes.
Toutefois, sachez que les laboratoires de vente directe au consommateur (DTC) peuvent ne pas adhérer à ces normes strictes.Bien que ces laboratoires puissent être approuvés par la Food and Drug Administration, les résultats d’un laboratoire non certifié par CLIA/CAP ne doivent pas être utilisés pour le diagnostic ou pour prendre des décisions de traitement.
Que porter
Si une prise de sang est nécessaire, veillez à porter des manches courtes ou un haut dont les manches peuvent être facilement retroussées. Pour un dépistage prénatal ou une biopsie, il peut vous être demandé de vous déshabiller partiellement ou entièrement. Si tel est le cas, laissez tous vos objets de valeur à la maison. Une blouse d’hôpital sera fournie si nécessaire.
Nourriture et boisson
De manière générale, il n’y a aucune restriction en matière de nourriture ou de boisson pour un test génétique. Manger, boire ou prendre des médicaments n’affectera pas le résultat du test.
Bien qu’il n’y ait aucune restriction alimentaire pour le dépistage prénatal de l’ADN, les liquides doivent être évités avant l’amniocentèse afin que la vessie soit vide et moins susceptible d’être perforée. En revanche, vous aurez peut-être besoin d’une vessie pleine pour un CVS et il vous sera demandé de boire plus de liquides.
Des restrictions en matière de nourriture et de boissons peuvent également s’appliquer à certaines procédures de biopsie, en particulier celles qui impliquent le tractus gastro-intestinal ou nécessitent une sédation. Parlez avec votre professionnel de la santé pour vous assurer que vous respectez les directives alimentaires appropriées.
Vous devrez également informer votre médecin si vous prenez des anticoagulants (anticoagulants) ou de l’aspirine avant une biopsie, car cela peut favoriser les saignements. En règle générale, il est important d’informer votre médecin de tout médicament que vous prenez, prescrit ou non, avant tout examen ou enquête médicale.
Quoi apporter
Assurez-vous d’apporter votre pièce d’identité et votre carte d’assurance maladie à votre rendez-vous. Si la procédure implique une sédation de quelque nature que ce soit, organisez un service de voiture ou amenez un ami pour vous reconduire chez vous après le rendez-vous.
Coût et assurance maladie
Le coût d’un test génétique peut varier énormément, allant de moins de 100 $ à bien plus de 2 000 $, selon l’objectif et la complexité du test. Cela n’inclut pas le coût supplémentaire lié à l’obtention d’un échantillon de liquide ou de tissu lorsqu’un dépistage prénatal ou une biopsie tissulaire est indiqué.
La plupart des tests génétiques nécessitent une préautorisation d’assurance. Certains, comme le dépistage néonatal et les tests BRCA utilisés pour dépister le cancer du sein, sont classés comme prestations de santé essentielles (EHB) en vertu de la loi sur les soins abordables, ce qui signifie que votre assureur est tenu de couvrir gratuitement le coût du test et du conseil génétique.
Dans l’ensemble, les tests génétiques sont approuvés s’ils aident à prévenir la progression de la maladie ou à améliorer les résultats du traitement. Cela étant dit, les coûts de quote-part et de coassurance peuvent souvent être prohibitifs. Si un test génétique est approuvé par votre assureur, assurez-vous de lui parler de toutes les dépenses personnelles que vous êtes susceptible d’engager.
Si vous n’êtes pas assuré ou sous-assuré, demandez si le laboratoire propose une option de paiement mensuel ou un programme d’assistance aux patients avec une structure de prix échelonnée pour les familles à faible revenu.
Les tests d’ascendance destinés directement au consommateur coûtent entre 50 $ et 200 $ et ne sont pas couverts par une assurance. Les tests facultatifs, tels que les tests de paternité, ne sont généralement jamais couverts par l’assurance maladie, même s’ils sont exigés par un tribunal.
Autres considérations
Certaines personnes préféreront payer de leur poche si elles craignent qu’un résultat de test positif puisse avoir un impact sur leur capacité à obtenir une assurance. Bien que l’assurance maladie ne soit généralement pas un problème, appelez le bureau du procureur général de votre État pour comprendre les lois sur la confidentialité en matière de santé dans votre État, ainsi que celles de la loi fédérale sur la portabilité de l’assurance maladie (HIPAA) de 1996.
Cela inclut l’utilisation de kits génétiques domestiques dans lesquels les fabricants vendront parfois vos données (généralement regroupées sans votre nom) à des sociétés biomédicales et pharmaceutiques.
Si votre secret médical est violé pour quelque raison que ce soit, vous pouvez soumettre une plainte relative à la confidentialité HIPAA au Bureau des droits civils du ministère américain de la Santé et des Services sociaux.
Pendant l’épreuve
Votre expérience en matière de tests dépendra du type de test génétique que vous effectuez, mais certains aspects s’appliquent à tous les niveaux.
Pré-test
Après avoir signé avec votre pièce d’identité et votre carte d’assurance maladie, vous subirez une forme de conseil préalable au test. Les conseils peuvent varier en fonction des objectifs de la procédure.
À des fins de diagnostic, comme la confirmation d’une maladie de longue date (comme la maladie de Crohn) ou l’extension de l’investigation d’une maladie connue (comme le cancer), le conseil préalable peut être limité à la compréhension des objectifs et des limites du test.
À des fins de dépistage ou de prévision, comme l’identification d’une anomalie congénitale prénatale, l’évaluation de votre prédisposition au cancer ou l’estimation de votre risque d’être porteur d’une maladie, le conseil génétique visera à vous aider à mieux comprendre la valeur et les inconvénients des tests génétiques.
Quoi qu’il en soit, l’objectif du conseil génétique est de garantir que vous êtes en mesure de fournir ce qu’on appelle un consentement éclairé. Ceci est défini comme l’octroi d’une autorisation, sans coercition ni influence, sur la base d’une pleine compréhension des avantages et des risques d’une procédure.
Le but du conseil est de s’assurer que vous comprenez :
- Le but de l’examen
- Le type et la nature de la condition faisant l’objet de l’enquête
- La précision et les limites du test
- Autres options de test que vous pouvez choisir
- Les options qui s’offrent à vous si un trouble est identifié
- Décisions que vous devrez peut-être prendre en fonction des résultats
- La disponibilité de services de conseil et de soutien
- Votre droit de refuser un test
- Votre « droit de ne pas savoir » sur les conditions dépassant la portée de l’enquête
Un conseiller en génétique certifié vous guidera ensuite tout au long du test et vous indiquera quand les résultats peuvent être attendus. Assurez-vous de poser autant de questions que nécessaire, en particulier si vous êtes confronté à une situation difficile, telle qu’une interruption de grossesse.
Tout au long des tests
Une fois le conseil terminé, l’échantillon sera obtenu pour les tests. L’échantillon est obtenu des manières suivantes :
- Un frottis buccalest réalisée en frottant du coton le long de la surface intérieure de la joue. L’écouvillon est ensuite placé dans un tube en plastique scellé et envoyé au laboratoire.
- Une prise de sangest réalisée par un phlébotomiste en insérant une aiguille dans une veine et en extrayant 1 à 3 millilitres de sang dans un tube à essai.
- Un échantillon de salives’obtient simplement en vous faisant cracher dans un récipient stérile
- Dépistage néonatal, appelé test de Guthrie, consiste à piquer le talon pour obtenir quelques gouttes de sang. Les gouttes sont déposées sur une carte de gouttes de sang et envoyées au laboratoire.
- Amniocentèseimplique l’insertion d’une fine aiguille creuse à travers la paroi abdominale et dans votre utérus pour recueillir une petite quantité de liquide amniotique.
- CVSimplique l’insertion d’un cathéter à travers le col de l’utérus ou la paroi abdominale pour obtenir un échantillon de tissu du placenta.
- Aspiration à l’aiguille fine (FNA)etaspiration à l’aiguille (CNA)are performed by inserting a needle through the skin into a solid tumor or bone marrow.
Bien que la biopsie chirurgicale, par chirurgie ouverte ou laparoscopique, puisse être utilisée pour obtenir des tissus difficiles à atteindre, elle ne sera presque jamais réalisée dans le seul but d’obtenir un échantillon génétique. Des échantillons de tissus peuvent également être obtenus en complément d’autres procédures de diagnostic direct, telles qu’une coloscopie ou une endoscopie.
Post-test
Dans la plupart des cas, vous pourrez rentrer chez vous une fois l’échantillon génétique obtenu. Si une sédation a été utilisée (pour une coloscopie ou une biopsie de la moelle osseuse, par exemple), vous devez rester en convalescence jusqu’à ce que le personnel médical approuve votre libération, généralement dans un délai d’une heure. Dans ce cas, quelqu’un devra vous reconduire chez vous.
Après l’épreuve
Toute procédure impliquant une aiguille comporte un risque d’infection, de douleur, d’ecchymoses et de saignement. Appelez votre médecin si vous développez une forte fièvre ou si vous ressentez une rougeur, un gonflement ou un écoulement du site de biopsie. Ceux-ci peuvent être des signes d’infection nécessitant un traitement rapide.
Si une sédation a été utilisée, vous pourriez ressentir des étourdissements, de la fatigue, des nausées ou des vomissements à court terme une fois de retour à la maison. Les symptômes ont tendance à être légers et disparaissent généralement en une journée. Si les symptômes persistent ou si vous ressentez un rythme cardiaque anormalement ralenti (bradycardie), appelez immédiatement votre médecin.
Au laboratoire
Selon les objectifs du test, l’échantillon peut subir l’un des nombreux processus permettant d’isoler le gène étudié. L’un de ces processus, la réaction en chaîne par polymérase (PCR), est utilisé pour « amplifier » le nombre de brins d’ADN dans un échantillon de sang de quelques milliers à plusieurs millions.
L’échantillon est ensuite soumis à un processus appelé séquençage de l’ADN pour identifier le codage ATCG exact dans l’ADN. Le résultat est analysé par ordinateur pour comparer la séquence à celle de la référence du génome humain.
Un rapport est ensuite généré répertoriant toutes les variantes, normales et anormales, dont les informations peuvent nécessiter une interprétation par un expert appelé généticien.
Interprétation des résultats
Selon le test et l’installation de test utilisée, l’obtention des résultats de votre test peut prendre entre une et quatre semaines. Les laboratoires commerciaux ont tendance à être plus rapides que les laboratoires institutionnels ou de recherche.
Si le test a été effectué à des fins de diagnostic, les résultats seront généralement examinés avec vous par le professionnel de la santé qui a ordonné le test. Un tel exemple est celui d’un spécialiste du VIH qui ordonne un génotypage pour déterminer quels médicaments seront les plus efficaces en fonction du génotype de votre virus.
Si le test est utilisé à des fins prédictives ou de dépistage, un conseiller en génétique peut être sur place pour expliquer ce que signifient et ne signifient pas les résultats.
Pour la plupart, les tests monogéniques donneront un résultat positif, négatif ou ambigu. Par définition :
- Un résultat positifindique qu’une « mutation délétère » (également appelée « mutation pathogène ») a été trouvée. Une mutation délétère est une mutation dans laquelle le risque de maladie est accru, mais pas nécessairement certain.
- Un résultat négatifsignifie qu’aucune mutation génétique n’a été trouvée.
- Un résultat ambigu, souvent décrite comme une « variation de signification incertaine » (VUS), décrit une mutation dont l’impact est inconnu. Bien que bon nombre de ces mutations soient inoffensives, certaines peuvent en réalité être bénéfiques.
Suivi
Les résultats des tests génétiques peuvent servir soit de point final, permettant un diagnostic définitif et un plan de traitement, soit de point de départ, nécessitant une enquête plus approfondie ou une surveillance de votre santé.
Parmi certains des scénarios auxquels vous pourriez être confronté :
- Toute anomalie détectée lors du dépistage néonatal nécessite des tests supplémentaires et/ou une surveillance continue de la santé de l’enfant pour identifier de manière proactive les symptômes.
- Les anomalies découvertes lors du dépistage prénatal peuvent nécessiter des thérapies préventives pour minimiser l’impact de la maladie et/ou l’avis d’experts médicaux pour vous aider à décider de poursuivre ou non la grossesse.
- Toute anomalie détectée lors des tests de dépistage des porteurs peut nécessiter l’intervention d’un généticien (pour déterminer les risques que votre bébé ait une anomalie congénitale) et d’un spécialiste de la fertilité (pour explorer d’autres moyens de conception).
- Toute anomalie détectée dans un test prédictif nécessite l’intervention du spécialiste approprié pour explorer d’autres tests ou options de traitement. Cela peut inclure des procédures préventives, telles que la mastectomie prophylactique, pour éviter une maladie si votre génétique et d’autres facteurs de risque vous exposent à un risque exceptionnellement élevé.
Un mot de Gesundmd
Si les tests génétiques peuvent être bénéfiques pour la santé et le bien-être de nombreuses personnes, ils peuvent compliquer la vie d’autres. Lorsqu’il est utilisé à des fins facultatives, de dépistage ou prédictives, il ne doit être entrepris que lorsque vous comprenez pleinement les avantages et les inconvénients des tests.
Après avoir reçu un résultat positif, certaines personnes peuvent avoir besoin du soutien de psychologues et d’autres personnes pour les aider à prendre des décisions compliquées ou à faire face aux incertitudes auxquelles elles pourraient être confrontées. À cette fin, la plupart des spécialistes en génétique travailleront avec des professionnels de la santé mentale capables d’aider les gens à faire face à de telles situations.
