Hybridation in situ par fluorescence (test FISH)

Qu’est-ce que l’hybridation in situ par fluorescence (test FISH) ?

L’hybridation in situ par fluorescence (FISH) est une technique utilisée par les pathologistes dans les tests génétiques pour aider à diagnostiquer les maladies causées par des différences chromosomiques. Les prestataires de soins de santé peuvent également utiliser FISH pour détecter des modifications génétiques qu’ils peuvent cibler pour traiter le cancer. FISH utilise des protéines ou des marqueurs chimiques pour « peindre » des parties de chromosomes ou de gènes que les pathologistes recherchent pour diagnostiquer des maladies. Les étiquettes ressemblent à des lumières colorées au microscope.

Vos gènes portent des informations sur eux sous forme d’ADN. L’ADN est comme un manuel d’instructions qui indique à votre corps comment fonctionner. Les gènes sont organisés sur des structures filiformes appelées chromosomes. Si quelque chose ne va pas dans votre manuel d’instructions – comme si certains mots sont supprimés, répétés ou déplacés – cela peut donner de mauvaises instructions à vos cellules. Des gènes uniques ou des chromosomes entiers d’informations peuvent être manquants (suppression), dupliqués (amplification) ou déplacés vers un autre endroit (translocation). Ces différences peuvent entraîner des changements dans le fonctionnement de votre corps ou provoquer des maladies comme le cancer.

Que peut-on tester avec FISH ?

L’hybridation in situ par fluorescence est le plus couramment utilisée pour tester :

• Mutations génétiques à grande échelle dans le cancer. Les prestataires de soins de santé peuvent utiliser ces mutations génétiques pour diagnostiquer ou déterminer un traitement.
• Anomalies chromosomiques avant ou après la naissance.
• Anomalies chromosomiques chez un embryon lors de tests génétiques préimplantatoires dans le cadre d’une FIV (fécondation in vitro).

Comment fonctionne l’hybridation in situ par fluorescence ?

Si l’ADN est un manuel d’instructions, un test FISH revient un peu à mettre en évidence des sections importantes avec une encre spéciale afin qu’un pathologiste puisse trouver ce qu’il cherche. Les scientifiques fabriquent ce surligneur en marquant les brins d’ADN avec des marqueurs fluorescents. C’est ce qu’on appelle la sonde.

L’ADN se présente sous forme de brins appariés qui s’agencent les uns aux autres, comme les dents d’une fermeture éclair. Les scientifiques séparent ces deux brins à la fois dans leur sonde et dans l’échantillon qu’ils testent. Ils créent la sonde afin qu’elle corresponde à un brin contenant la séquence d’ADN – comme une phrase sur une page – qu’ils recherchent.

Pour effectuer le test, ils mélangent leurs sondes avec l’échantillon d’ADN provenant de tissus ou de fluides corporels (la cible). Si les sondes trouvent de l’ADN avec la phrase qu’elles recherchent, elles s’y tiennent (s’hybrident). Les étiquettes mettent en valeur cette partie de l’ADN avec des couleurs vives. Lorsqu’un pathologiste l’examine avec un microscope spécial, il peut voir les étiquettes s’allumer, lui indiquant que l’information est là – et quelle quantité.

Modifications génétiques détectées par FISH

Les pathologistes peuvent utiliser FISH pour tester les cellules à la recherche de mutations génétiques connues pour provoquer des cancers spécifiques ou d’autres conditions. Il est également parfois utilisé pour confirmer ou clarifier les résultats du caryotypage. Les changements spécifiques que FISH peut détecter incluent :

• Amplifications.L’amplification signifie qu’il y a plus de copies d’un gène que prévu. Semblable à la recherche de chromosomes supplémentaires, les scientifiques peuvent utiliser FISH pour voir s’il existe plus de copies d’un gène spécifique que prévu.
• Translocations/réarrangements.La translocation, ou réarrangement, signifie qu’une partie d’un gène ou d’un chromosome s’est déplacée vers un emplacement différent. Les scientifiques peuvent utiliser deux sondes de couleurs différentes pour rechercher des translocations. Dans un gène normal, les sondes doivent apparaître les unes à côté des autres. Si elles sont transférées, les couleurs seront séparées.
• Suppressions.À l’instar des translocations, les scientifiques peuvent utiliser plusieurs sondes pour rechercher les zones d’ADN pour lesquelles il manque des informations. Certaines sondes peuvent adhérer à une section de l’ADN de l’échantillon et d’autres ne collent pas là où elles le devraient. Si l’ADN n’est pas étiqueté là où il devrait être, certaines informations manquent (suppression).

Les prestataires peuvent utiliser FISH pour détecter les modifications génétiques qui diagnostiquent :

• Lymphome.
• Leucémie myéloïde aiguë, leucémie myéloïde chronique et autres formes de leucémie.
• Myélome multiple.
• Cancer de la vessie.
• Gliome.
• Mésothéliome.
• ELLE2amplification (le plus souvent trouvé dans le cancer du sein, mais peut également être trouvé dans le cancer de l’estomac et du poumon).
• RENCONTRÉamplifications (le plus souvent trouvées dans le cancer du poumon, de l’estomac et de l’œsophage).
• MYCNamplification dans le neuroblastome.
• ALK,RETRAITetROS1réarrangement/fusion dans le cancer du poumon non à petites cellules.ALK,RETRAITouROS1peut se réorganiser et fusionner avec un autre gène, provoquant le cancer.

Comment se préparer à un test FISH ?

Les prestataires testent un échantillon de liquide ou de tissu corporel pour l’analyse FISH. Votre préparation au test dépend du type d’échantillon dont votre prestataire a besoin :

• Pour les tests prénatals, votre prestataire effectuera une amniocentèse.
• Pour les tests préimplantatoires (diagnostic génétique préimplantatoire/DPI ou dépistage génétique préimplantatoire/PGS), votre prestataire testera quelques cellules d’embryons avant l’implantation. Cela se produit généralement quelques jours après la récupération des ovules.
• Si un prestataire pense que vous ou votre enfant souffrez d’une maladie causée par une anomalie chromosomique ou une mutation génétique, il peut la détecter par une analyse de sang.
• Pour diagnostiquer un cancer ou des mutations génétiques dans les cellules tumorales (tests moléculaires), vous aurez besoin d’une biopsie de la tumeur ou de la moelle osseuse.
• Un test d’urine (pipi) FISH est parfois utilisé pour diagnostiquer ou surveiller le cancer de la vessie.

Généralement, le seul de ces tests pouvant nécessiter une préparation est une biopsie. Étant donné que de nombreuses biopsies sont effectuées sous anesthésie, vous devez suivre les instructions de votre prestataire sur la façon de vous préparer.

Comment les pathologistes réalisent-ils l’hybridation in situ par fluorescence ?

Pour une analyse FISH, un pathologiste ou un technicien de laboratoire :

1. Concevoir la ou les sondes.Cela implique de sélectionner des sections d’ADN qui correspondent à la séquence recherchée. Ensuite, ils font de petites coupures dans l’ADN et ajoutent des marqueurs fluorescents.
2. Dénaturer les sondes et la cible.Cela signifie traiter les sondes et la cible de manière à ce que les deux brins se séparent.
3. Hybridation.Lorsqu’elles sont mélangées à un échantillon d’ADN provenant de tissus ou de fluides corporels, les sondes se fixent sur des sections d’ADN contenant les séquences recherchées.
4. Examinez les résultats.Ils utiliseront un microscope fluorescent pour voir quelles zones de l’échantillon sont mises en évidence avec des étiquettes.

Le pathologiste communiquera les résultats à votre prestataire.

Quel type de résultats obtenez-vous d’un test FISH ?

Le type de résultats que vous obtenez d’un test FISH dépend du type de test dont vous disposez. Un test FISH positif signifie que les cellules de l’échantillon présentent une anomalie chromosomique ou génétique. Demandez à votre prestataire à quoi vous attendre en termes de résultats et ce que signifient ces résultats.

Que se passe-t-il si un test FISH est positif ?

Si un test FISH est positif, votre prestataire peut vous aider à comprendre ce que cela signifie et quelles sont vos options. Si le test visait des mutations génétiques dans le cancer, il peut exister des options de traitement ciblant cette mutation spécifique.

Quand dois-je connaître les résultats d’un test FISH ?

Les résultats des tests FISH peuvent prendre une à quatre semaines pour revenir. Votre prestataire peut vous indiquer quand les attendre et comment vous obtiendrez les résultats.

Quand dois-je appeler mon médecin ?

Contactez votre professionnel de la santé si vous avez des questions sur le test ou les résultats que vous obtenez.