À quelle famille appartient l’hépatite E ?
Le virus de l’hépatite E (VHE) appartient à la famille des Hepeviridae. Le génome du VHE est une molécule d’ARN d’environ 7,2 kb, simple brin et de sens positif. L’Orthohepevirus est un genre de virus appartenant à la famille des Hepeviridae. Le VHE appartient au genre Orthohepevirus, qui comprend quatre génotypes reconnus et au moins deux nouveaux génotypes putatifs.
Génotype du VHE
Sur quatre génotypes, 1 et 2 provoquent d’importantes épidémies d’infections aiguës par le VHE chez l’homme. Il est courant en Asie, au Mexique et dans de nombreux pays africains, tandis que les génotypes 3 et 4 sont associés à des cas sporadiques, groupés et chroniques de VHE chez l’homme. Il est surtout connu pour être zoonotique et a été isolé d’animaux domestiques et d’animaux sauvages.
Homologie de séquence
Certaines études indiquent que le VHE ne peut pas être classé car il partage un génome similaire à celui des Caliciviridae, mais les analyses de séquence suggèrent qu’il est plus étroitement associé à la famille des Togaviridae. Il reste en état de transition. Cependant, la déclaration la plus récente du Comité international de taxonomie des virus a regroupé le VHE avec les génotypes 1 à 4 sous la catégorie des Hepeviridae. Le nouveau génotype a été attribué au VHE aviaire, dont on a récemment identifié la virulence envers les chauves-souris et les furets.
Le VHE aviaire isolé des poulets partage 50 % de sa séquence nucléotidique avec le VHE des mammifères. Par conséquent, les VHE aviaires nécessitent probablement un nouveau genre. Le VHE de rat nouvellement identifié partage 59,9 % et 49,9 % d’identités de séquence avec le VHE humain et aviaire, tandis que le VHE du furet partage l’identité de séquence la plus élevée avec le VHE de rat à 72,3 %. Il a récemment été proposé que le genre Orthohepevirus englobe à la fois les souches de VHE de rat et de furet ainsi qu’une nouvelle souche de VHE de sanglier récupérée au Japon qui différait des isolats connus de VHE des génotypes 1 à 4 de 22,6 à 27,7 % en termes d’identité de séquence nucléotidique. Un HEV de chauve-souris a été récemment identifié chez des chauves-souris d’Afrique, d’Amérique centrale et d’Europe, et en raison de la forte diversification des séquences des isolats connus de HEV avec une identité de séquence d’acides aminés de 47 %, le HEV de chauve-souris forme un nouveau clade phylogénétique. Il a été proposé que le genre Chiropteranhepevirus inclut toutes les variantes du HEV de chauve-souris. Enfin, une souche de VHE a également été identifiée chez la truite fardée aux États-Unis avec seulement 13 à 27 % d’homologie de séquence avec des hépvirus de mammifères ou d’oiseaux, ce qui a conduit à la proposition d’un autre genre provisoire, Piscihepevirus, au sein de la famille des Hepeviridae.
Biologie du VHE
Le génome se compose de trois cadres de lecture ouverts (ORF), d’une région non codante (NCR) 5 ‘et d’une NCR 3’. ORF1 code pour des protéines non structurelles avec des domaines conservés fonctionnant comme une méthyltransférase, une hélicase, une ARN polymérase dépendante de l’ARN (RdRp) et une cystéine protéase de type papaïne. De plus, une région hypervariable (HVR) au sein d’ORF1 peut jouer un rôle dans la pathogenèse virale même s’il a été démontré qu’elle n’a aucune influence sur l’infectiosité virale. ORF2 code pour la protéine de capside immunogène, qui interagit avec l’ARN génomique viral 3 ‘pour l’encapsidation et contient un peptide signal du réticulum endoplasmique et des sites de N-glycosylation en 3’. ORF3 code pour une petite phosphoprotéine dont les fonctions sont incomplètement comprises ; cependant, l’association avec le cytosquelette et sa nécessité pour une infection virale in vivo chez les macaques rhésus suggèrent qu’ORF3 joue un rôle dans la réplication et l’assemblage viraux.
Lire aussi :
- Hépatite chronique : causes, symptômes, signes, traitement, prévention, pronostic, enquêtes
- Hépatite A : signes, symptômes, diagnostic, prévention, traitement, pronostic
- Hépatite virale : A, B, C, définition, causes, symptômes, phases de manifestations cliniques, diagnostic, traitement
- Hépatite toxique : définition, causes, facteurs de risque, symptômes, complications, diagnostic, traitement
- Hépatite néonatale : définition, causes, symptômes, diagnostic, traitement, complications
- Hépatite auto-immune ou AHIA : causes, types, facteurs de risque, symptômes, diagnostic, traitement, complications
- Hépandnavirus ou virus de l’hépatite B
- Qu’est-ce que l’hépatite C, comment se propage-t-elle et comment prévenir les lésions hépatiques liées à l’hépatite C
